Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scamp5Q9JKD3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms