Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uchl3Q9JKB1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uchl3Q9JKB1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms