Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdk2Q9JK42 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdk2Q9JK42 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms