Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rilpl1Q9JJC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rilpl1Q9JJC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rilpl1Q9JJC6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms