Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms