Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbr1Q9JIT0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1Q9JIT0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbr1Q9JIT0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms