Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2aQ9JIS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms