Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc22Q9JIG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms