Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EefsecQ9JHW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms