Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms