Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcirg1Q9JHF5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms