Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ripk4Q9ERK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ripk4Q9ERK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms