Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MesdQ9ERE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms