Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slco1c1Q9ERB5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slco1c1Q9ERB5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms