Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfip11Q9ERA6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfip11Q9ERA6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms