Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dap3Q9ER88 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dap3Q9ER88 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dap3Q9ER88 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms