Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ndst4Q9EQW8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Ndst4Q9EQW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst4Q9EQW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst4Q9EQW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms