Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms