Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3bpQ9EQG9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms