Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ropn1lQ9EQ00 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms