Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpsf1Q9EPU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpsf1Q9EPU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms