Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clstn1Q9EPL2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms