Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rarres2Q9DD06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rarres2Q9DD06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms