Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop7Q9DCH2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pop7Q9DCH2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms