Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde1Q9DBZ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde1Q9DBZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms