Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PacrgQ9DAK2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PacrgQ9DAK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.4 ms