Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem239Q9DA47 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem239Q9DA47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms