Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms