Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp12Q9D9M2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp12Q9D9M2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms