Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc2Q9D968 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hcfc2Q9D968 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcfc2Q9D968 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms