Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot8Q9D8X5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms