Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms