Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jam3Q9D8B7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms