Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan17Q9D7W4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms