Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lysmd2Q9D7V2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms