Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc94Q9D6J3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms