Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2900055J20RikQ9D6G3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1468.6 ms