Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms