Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gins2Q9D600 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gins2Q9D600 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gins2Q9D600 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms