Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc81Q9D5W4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms