Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4f1Q9D5Q6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms