Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn11Q9D572 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms