Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3a3Q9D554 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms