Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc7Q9D541 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms