Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam227bQ9D518 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms