Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrameQ9D4Z5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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