Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al3Q9D4U4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms