Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf3Q9D4H7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms