Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4A5

Uncharacterized protein C16orf86 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4A5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4A5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4A5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms