Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cfap53Q9D439 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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