Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pus10Q9D3U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pus10Q9D3U0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms